El azul de bromofenol se usa como colorante de seguimiento en electroforesis en gel de ADN, ARN (agarosa) y proteína (poliacrilamida). El azul de bromofenol migra aproximadamente a la misma velocidad que el ADN de 300-500 pb en gel de agarosa y en el frente del tampón en geles de poliacrilamida de proteína.